《北冥有鱼》的故事构想出自庄子的《逍遥游》，作者刘畅花费两年时间构思，将古老寓言改编成一个浪漫而又感伤的奇幻故事，让梦境和现实相互穿插，实现了一种不可能的对话。

鱼还是条小鱼时，小女孩无意间救了它。从此以后，鱼会来到女孩梦中和她说话。

鱼的身体不断长大，当它掀起翻覆小镇的骇浪，也只有小女孩能了解大鱼内心的愧疚。

为了不再伤害小镇，大鱼只身游往遥远的北海，有一天海水退潮，大鱼竟然在岸上搁浅了……

最终，大鱼化身为巨鸟飞往另一个星球。

因为这个故事是对传统经典的改编，最初，刘畅想把《北冥有鱼》做成一个长卷，但考虑到不适合大量印刷，就换为了长条版式。

在创作中，刘畅发现在这种非常窄的版面里，如果在图上再放文字会影响阅读体验，于是就将图文拆开，为读者营造一种在看画面时仿佛听到有人念旁白的感觉。